Su carrera comenzó en la Escuela Superior del KGB, la agencia de seguridad e inteligencia de la Unión Soviética. En 1989, el virus Cascade infectó su computadora y Eugene Kaspersky, experto en criptografía, descifró y analizó el malware para comprender cómo funcionaba. Creó una herramienta para eliminarlo y la compartió entre sus allegados. En 1992 (ya disuelta la URSS y convertido en geek) comenzó a comercializar esta solución antivirus. En 1997 fundó una empresa de seguridad IT con su apellido.